Un daño colateral de la instalación que hice ayer por la noche del APC. Resulta que solo falla en drupal 7, en la versión 6 va bien.
Para solucionarlo hay que cambiar…
apc.include_once_override = 1
en vez de
apc.include_once_override = 0
en el fichero /etc/php5/apache2/php.ini
Según la documentación de php es una función experimental que «optimiza las llamadas a include_once y require_once y evita las caras llamadas al sistema utilizadas.»
Pues el experimento no ha salido bien, así que toca desactivarlo.